聚类热图（Cluster heatmap）常用于大数据表数据关系的可视化展示，以便快速阅读和发...

主成分分析（Principal Component Analysis，PCA），是对原有的复杂...

本工具为绘制气泡图，用于展示富集分析结果中P值最小的前N个功能或者通路。通过气泡图，可以生动地...

Venn图，又称韦恩图或文氏图，是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形。
Venn图在生物...

火山图（Volcano Plot）是一类用来展示组间差异数据的图像，可以方便直观的展示两组样本...

本工具为绘制GO富集条形图。
Gene Ontology(GO) 数据库提供了专业的术语来定...

本工具为绘制累计柱状图，柱状图是一种以矩形的长度（高度）为变量的统计图表，只包含一个变量，从形...

本工具为绘制蛋白或代谢相关性图。
通过相关性分析可以帮助衡量显著差异代谢物之间的相关密切程度...

PCoA（principal co-ordinates analysis）是一种研究数据相似性...

本工具可用于绘制条形图，常用于展示富集分析的结果。

本工具用于box-plot及小提琴图 (Violin Plot)，适用于组别为2组及以上，组内...

LEfSe分析即 Linear discriminant analysis Effect Si...

本工具为绘制ROC曲线。
根据特征数据丰度，如差异物种或生物标记物等，利用10折交叉验证，对...

根据基因表达矩阵文件计算样本之间的相关性

本工具为绘制Venn图。Venn图是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形，在生物信息学领域常...

本工具根据所提供的基因表达量数据，进行可视化分析，以便快速阅读关注基因的表达水平变化规律。

本工具为绘制芯片散点图。
芯片数据分组比较后的差异基因数据经过quantile normal...

根据counts信息对样本进行聚类

本工具为绘制upset图，是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形。
相较于venn图可以绘...

基因表达箱线图统计每个样本表达量中的5个值：最小值、第一四分位数（25%）、中位数（50%）、...

基于miranda序列匹配画图：使用miRNA和靶基因序列进行结合位点绘制，更加直观的显示mi...

该工具功能包括GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedi...

RDA/CCA 为基于对应分析发展的一种排序方法，将对应分析与多元回归分析相结合，每一步计算均...

本工具为分析变量间的相关关系，比如gene和lncRNA，微生物和代谢产物之间的相关性等。

本工具为miRNA靶标预测(基于miRDB和miRWalk数据库)。
使用miRDB和miR...

一个基因的表达变化从一个时间点往下一个时间的变化主要有三种趋势，即 增加 、不变 和 减小 。...

本工具使用miranda软件预测靶标关系。

1.提供感兴趣的目标基因/蛋白/代谢物，从一张表格中提取相关的信息（含有目标列的表格）
2....

KEGG( https://www.kegg.jp/ )数据库的构建旨在了解生物系统（如细胞，...

本工具针对富集结果添加各条目对应基因的信息(上下调，差异倍数，表达情况等)

PICRUSt2 基于标记基因序列预测功能丰度，“功能”通常是指基因家族，如 KEGG 同源，...

ESTIMATE是一种预测肿瘤纯度的软件，基于ssGSEA算法，利用表达数据预测肿瘤组织中浸润...

本工具为差异分析，旨在找出不同样本间的差异表达情况。
利用R中的DESeq或DESeq2包对...

差异统计分析小工具，用于对芯片、测序、qPCR、蛋白、代谢、微生物等标准化后的数据，进行差异计...

本工具用于结合分组信息对Ct值表进行定量计算。

随机森林是一种机器学习算法，最早由 Leo Breiman 和 Adele Cutler 提出...

FDR( false discovery rate) 错误发现率，含义是错误拒绝（拒绝真的（原...

Agilent芯片差异分析：对标准化数据进行差异分析。

采用多维分析和单维分析相结合的办法，来筛选组间差异代谢产物。

根据样本一一对应关系对，计算微生物(OTU/门/纲/目/科/属/种)的相对丰度，与对应代谢物的...

本工具为组学关联散点图（Scatter plot），可以通过两组学在二维（即水平X轴和垂直Y轴...

本工具为绘制双饼环图，可以分别展示蛋白和基因层面在不同GO分类中的占比，了解生物学过程（BP）...

本工具为fasta序列转化，可将fasta序列转化成以下形式：互补序列，反向序列，反向互补序列...

本工具为fastq序列转换成fasta序列。
输出文件名以输入文件夹决定，输出文件后缀为.f...

本工具从上传的序列文件中筛选出特定长度范围内的序列。
输出文件名由输入文件名决定，并以.fa...

本工具根据提供的位点和序列，提取位点前后固定长度的序列。

输出文件名以输入文件名决定，并...

本工具为序列文件信息统计，包括序列文件中序列个数，序列总长度，序列总GC含量，N50，N90，...

提取fasta序列文件中特定基因的序列。 （仅支持200Mb以下文件）