聚类热图（Cluster heatmap）常用于大数据表数据关系的可视化展示，以便快速阅读和发现规律。
1. 表达量矩阵文件
第一列为基因/蛋白/代谢物名称，其余各列为各样品中相应表达量。
demo数据下载：fpkm.3rep.xls
2. 样本分组信息文件（非必选）
第一列为样本分析名称"Sample", 与表达量矩阵列名保持一致，第二列为分组名称"Group"。
demo数据下载：group.xls
3. 注释信息文件（非必选）
第一列为特征名称, 与表达量矩阵行名保持一致，其余各列为特征的注释信息。
demo数据下载：phenotype.xls
1. 图形输出
示例图片为默认参数下的聚类热图。示例图片中，一个小方格代表一个基因，其颜色代表该基因表达量大小，红色表示高表达基因，蓝色表示低表达基因。图片上方树形图表示来自不同实验分组的不同样品的聚类分析结果，左侧树状图表示对来自不同样本的不同基因的聚类分析结果。
2. 表格输出
若选择行/列聚类，将输出聚类后顺序文件，“heatmap.reorder_cluster_result.xls”。示例图片中，基因名顺序已为聚类分析后排序，并补充各样本表达量信息。
(1) 尽量新建全新的excel文件进行数据筛选，不在源文件操作。
(2) 少于2个样本时，不绘制热图；仅2个样本时，不对数据进行归一化；
(3) 默认条件下，行列聚类，输出聚类后排序列表；当行不聚类时，限制绘图特征数目（数据量）不能多于 65536 个；当行聚类时，特征数目（数据量）不能多于14000个；
(4) 若显示特征名称时，字符串太长，可选择对字符串（70个字符）进行截取；
(5) 某特征在所有样本中数值相等（方差等于0）时将自动删除，并提供warning文件；
(6) 存在相同特征时，将自动计算表达量之和且保留高表达特征，并提供warning文件；
(7) 分析前请检查数据是否完整，不允许有空值。
(8) 一款简单易操作的编辑器：Notepad++，下载地址：https://notepad-plus-plus.org/
(9) 修改文件可进行以下操作：
在原始转录组报告结果(未进行修改)中，单击右键，以notepad++方式打开文件;
新建excel文件，选中第一列，在"单元格格式"中选择"文本"；
复制文本打开的源文件内容，粘贴到excel文件中，保存后进行修改。
(10) 修改文件切记：删除-整行/整列，而非"删除"或"清除内容"。
