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共表达相关性分析 48511 查看 本工具为分析同样本在不同组学间的相关关系，根据样本一一对应关系对，计算两个组学特征之间的相关性，或一个组学特征的自相关性（即两个不同的表或者相同的表），并做热图，矩阵图和网络关系图。相关性算法可选用的有pearson相关性、spearman相关性、kendall相关性。 组间boxplot图 39739 查看 本工具用于boxplot，适用于组别为2组及以上，组内有生物学重复的数据集。 箱线图（Box-plot）又称为箱形图，是一种用作显示一组及多组数据分布情况的统计图形。其绘图先找出及计算出每组数据的最大值、最小值、上四分位数、下四分位数和中位数这五个描述分布的参数（除去离群点）；然后从上四分位数和下四分位数出发延伸出两条横向线段作为上底边和下底边绘制一个矩形（形状像箱子），再从中位数出发延伸出一条横向线段将矩形分割成上下两部分；最后从上四分位数和下四分位数出发延伸出两条纵向线段至最大值和最小值。 旧版boxplot提供小提琴图的绘制 WGCNA 38198 查看 本工具用于加权基因共表达网络分析（WGCNA, Weighted Gene Co-Expression Network Analysis），从高通量表达数据中挖掘具有类似表达谱的基因模块(module)信息，探索模块内基因网络与关注表型之间的关联关系。 微生物和代谢物相关性 34592 查看 本工具根据样本一一对应关系对，计算微生物(OTU/门/纲/目/科/属/种)相对丰度与对应代谢物的响应强度数据之间的关联性，绘制相关性热图、网络图。 细胞表达可视化 29123 查看 本工具用于进行转录组中Featureplot、Violinplot、Dotplot基因表达可视化工具。 多元统计分析 23404 查看 多元变量统计分析（Multivariate Statistical Analysis），简称多元变量分析，又称多元统计分析，为统计学的一支，常用于管理科学、社会科学和生命科学等领域。 差异统计(组学通用) 21735 查看 本工具用于进行各组学数据的差异分析，提供31套配色可选，可绘制stamp，可选绘制每个特征的box-plot。 CCA-RDA分析 20823 查看 本工具是一种约束排序分析，将群落组成与环境因子联合分析。CCA 适配物种单峰响应模式，RDA 适配线性响应模式，直观展示样本、物种与环境因子的分布关系，识别影响群落分化的核心环境驱动因素。 蛋白代谢功能富集分析 20430 查看 本工具针对于蛋白和代谢差异数据进行的功能富集分析，包括GO、KEGG、Reactome、InterPro、PPInetwork和Wikipathways，属于代谢组分析。 样本相关性分析 16474 查看 本工具根据基因表达矩阵文件，使用pearson算法计算样本之间的相关性，绘制相关性系数热图。用于转录组分析。 相关性热图交互 15487 查看 本工具常用于算两个组学特征之间的相关性，或一个组学特征的自相关性（即两个不同的表或者相同的表），动态展示特征之间的关系，通过颜色梯度表征丰度高低，直观呈现样本分组模式以及差异特征的数据变化规律。 趋势分析 14584 查看 本工具用于趋势分析（STEM分析），通过构建基因表达变化趋势，将表达数据转换并计算与对应趋势的相似性，衡量基因所属趋势，同时利用随机重排得到一个期望的基因数量，并利用超几何分布算法计算各趋势的p-value。
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