本工具为绘制Venn图。Venn图是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形,在生物信息学领域常用于展示样品不同分组间共有和特有的物种,OTU,基因,分类单元等。
1. 丰度文件
表格第一列信息作为该表格的元素的集合,且不可重复(如OTU id,门水平物种,纲水平物种,目水平物种,科水平物种,属水平物种,种水平物种,探针,转录本,基因名称,名称需提前去重,重复会导致运行错误)
如下例表第一列为OTU id,其余各列为各样本中相应OTU丰度。
demo数据下载:OTUs.xls
2. 样本分组信息文件
第一列为样本分析名,与丰度文件中的样本分析名一致,第二列为分组名,需要剔除的样本不需要填写分组名。
demo数据下载:mapping.xls
1. 组内合并Venn图
三种颜色线构成的圈中数字1141代表A,B和C三组共有的元素个数;蓝色和绿色线构成的圈中数字187代表A和B共有的元素个数;42代表A组特有的元素个数。
(1) 本工具用于组内生物学重复合并做Venn分析,适用于适用于组别为5组及以下数据集;
(2) 可以选择剔除部分样本,合并后的数据集名为原来的组名,合并算法为组内取平均;