fasta序列转化

开发者:huanan  |  更新于1 月,1 周前  |  浏览量 176

本工具为fasta序列转化,可将fasta序列转化成以下形式:互补序列,反向序列,反向互补序列,转录序列,反转录序列以及翻译的蛋白序列;

输出文件名由输入文件名和转化类型决定,并以.fasta为后缀。

参数信息
相关数据
  • 使用说明
  • 结果说明
  • 版本信息
    1. 1. fasta文件格式

    1. (1)  第一行是由“>”开始的任意文字说明,用于序列标记,为了确保后续分析软件能够区分每条序列,单个序列的标识必须具有唯一性;

    2. (2)  第二行是碱基ATCG/ATCU序列,核苷酸符号大小写均可。


    demo_fa.png


        demo数据下载demo.fasta


    1. 1. 输出fasta序列文件

    1.     (1) 参数为“互补”时,输出序列文件的碱基互补序列;

    2.     (2) 参数为“反向”时,输出序列文件的反向序列;

    3.     (3) 参数为“反向互补”时,输出序列文件的反向碱基互补序列;

    4.     (4) 参数为“转录”时,输出序列文件的转录序列;

    5.     (5) 参数为“反转录”时,输出序列文件的逆转录序列;

    6.     (6) 参数为“翻译”时,输出序列文件的翻译序列。


    output_fa.png


    示例文件:demo_complement.fa




  • 版本
    更新日期版本信息
    v1.1
    2020.10.25
    更新说明文档