文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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提取fasta序列文件中特定基因的序列。 (仅支持200Mb以下文件)
任务正在排队中,目前后台任务排队数量:
当前任务开始运行后预计需要耗时
请勿重复提交任务!程序正在运行中,预计需要耗时
程序运行出错,报错信息如下:
1. 输入序列文件(fa 或者 fasta)
(1)第一行是由“>”开始的任意文字说明,用于序列标记,为了确保后续分析软件能够区分每条序列,单个序列的标识必须具有唯一性;
(2)第二行是碱基ATCG/ATCU序列,核苷酸符号大小写均可。
demo数据:gene.fa
2. 文本框输入
请用换行分隔基因名,否则可能会造成匹配失败。
输入框输入:
TRINITY_DN0_c0_g1_i1_2
LOC112268260
MEI4
IRAK1BP1
ROR2
Isoform_85535
!!!
12345
欧易生物
1. 结果示例1
首先会返回一个含匹配到的基因名及序列的output.fa文件,结果如下:
2. 结果示例2
若存在未匹配成功的基因,则会生成一个unfound_genes.txt文件。
其中包含了所有未匹配到的基因名。结果如下(顺序不定,""""""可忽视):
1. 基因名间用换行符相隔,否则可能会造成匹配不准确
版本 | 更新日期 | 版本信息 |
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v0.1 | 2021.05.26 | 更新说明文档 |