fa序列长度过滤

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开发者:zt  |  更新于1 月,3 周前  |  浏览量 81

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn.
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本工具从上传的序列文件中筛选出特定长度范围内的序列。
输出文件名由输入文件名决定,并以.fasta为后缀。

参数信息
  1. 输入文件为fasta格式,文件大小不能超过200M
  2. 设置要筛选出的序列最小长度,如果文件中序列长度小于该值,该序列将被过滤

查看更多非必选参数

  1. 设置要筛选出的序列最大长度(可不填),如果文件中序列长度大于该值,该序列将被过滤
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  • 版本信息
    1. 1. 输入fasta序列文件

    1. (1)第一行是由“>”开始的任意文字说明,用于序列标记,为了确保后续分析软件能够区分每条序列,单个序列的标识必须具有唯一性;

    2. (2)第二行是碱基ATCG/ATCU序列,核苷酸符号大小写均可。



    filter_fa.png



        demo数据下载:demo.fasta



    1. 1. 结果示例1

        输出长度范围内的fasta序列;示例中最小长度为200,最大长度为800


    an1.png


    1. 2. 结果示例2

        输出长度范围内的fasta序列;示例中最小长度为200,最大长度不限。


    an2.png


    1. (1) 输入序列文件必须为fasta格式文件;

  • 版本
    更新日期版本信息
    v1.1
    2020.10.25
    更新说明文档


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