基于miranda序列匹配画图:使用miRNA和靶基因序列进行结合位点绘制,更加直观的显示miRNA与靶基因的结合信息。1、输入的数据格式必须为fasta格式;2、仅适用于一对一的序列关系;3、输出图片格式:png
输入文件1和2皆为fasta格式:*.fa(或*.fasta)
1、第一行以‘>’开头的序列id,为了进行区分,请保证两个输入文件的id的唯一性;
2、第二行开始,是碱基序列。
demo数据下载:circRNA.fa miRNA.fa
分析结果:
1、结合位点图片;
2、"mirna_target_raw.txt"和 "mirna_target_Result.csv"文件
靶标的详细信息和结果文件
结果图片示例:*.png
使用miranda结果文件进行绘图。