小提琴图

开发者:wyl  |  更新于3 周,1 日前  |  浏览量 52

本工具用于微生物多样性alpha指数Violin分析,适用于组别为2组及以上,组内有生物学重复的数据集。
小提琴图 (Violin Plot)是用来展示多组数据的分布状态以及概率密度。这种图表结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。
与箱形图类似,但是在密度层面展示更好。在数据量非常大不方便一个一个展示的时候小提琴图特别适用。

参数信息
  1. alpha指数矩阵文件,列为样本指数值,行为alpha稀释步长。
  2. 样本分组信息文件,第一列为样本分析名,与OTU丰度文件中的样本分析名一致,第二列为分组名
    组别个数小于等与5组填写Wilcoxon,否则填写kruskal-wallis
相关数据
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  • 版本信息
    1. 1. alpha 指数文件

        第一列为alpha稀释步长样本列为样本指数值


    alpha.png



        demo数据下载alpha.xls


    2. 样本分组信息文件

        第一列为样本分析名需要与alpha 指数矩阵文件中的样本分析名一致,第二列为分组名。



    mapping.png


        demo数据下载mapping.xls


    1. 1. Violin结果示意图

        图展示多样性指数在各个组的分布情况,以及多样性指数在组间差异是否显著(如果组内无重复样则不能分析),其中横坐标为分组,不同组用不同颜色区分,纵坐标为指数值。在上图中,白点是中位数,白色盒型的范围是下四分位点到上四分位点,细黑线表示须。注;五组以下标记ns为无差异。


    violin.png


    1. (1) 适用于组别为2组及以上,组内有生物学重复的数据集;

  • 版本
    更新日期更新内容
    v1.1
    2020.10.25
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