GO双饼环图

开发者:haoyuqi  |  更新于1 月,1 周前  |  浏览量 140

本工具为绘制双饼环图,可以分别展示蛋白和基因层面在不同GO分类中的占比,了解生物学过程(BP)、细胞组成(CC)和分子功能(MF)三大功能中转录和蛋白所占条目比例。

参数信息
  1. 转录组中所有基因和差异表达基因GOlevel2条目统计 (ALL_vs_DEG.GO.level2.stat.mRNA.xls)
  2. 蛋白组中所有蛋白和差异表达蛋白GOlevel2条目统计 (ALL_vs_DEG.GO.level2.stat.protein.xls)
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    1. 1. 转录/蛋白输入文件

        第一列(#GO_classify1):GO分类的第一层级(包括biological process,cellular component,molecular function),每一层级的条目不得少于2个。

        第二列(#GO_classify2):所属第一层级的GO条目。

        第三列(Unigene) :检测基因的数目(或占比)。

        第四列(diff-Total) :差异基因总数(或占比)。

        第五列(Unigene) :检测基因的具体名称(若第三列数目为0,则该列用--表示)。

        第六列Gene(diff-Total) :检测基因的具体名称(若第三列数目为0,则该列用--表示)。



    pie.png


        demo数据下载:example.xls


    1. 1. GO双饼环图示例结果

        图中不同颜色为Biological Process层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。


    biological_process.png


        图中不同颜色为Cellular Component层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。


    cellular_component.png


        图中不同颜色为Molecular Function层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。


    molecular_function.png


    1. (1) 支持文本格式数据;

    2. (2) 外来数据格式不兼容时,请使用本工具前,按照输入示例文件格式对数据进行修改;

  • 版本
    更新日期更新内容
    v1.1
    2020.10.25
    更新说明文档